Лаборатория биохимии. Основные научно-практические достижения
_______________________________________________________________________________________________________________
Лабораторией руководит к.х.н. Ковалева Д.А.
_______________________________________________________________________________________________________________
Основные научно-практические достижения
В период существования лаборатории (с 2014 по настоящее время) получен ряд научных и научно-практических результатов:
- расшифрованы последовательности ДНК более 1000 геномов возбудителей особо опасных инфекционных болезней;
- налажено производство олигонуклеотидных праймеров для детекции и идентификации возбудителей особо опасных инфекций в рамках деятельности профильных подразделений и СПЭБ ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора;
- предложен гибкий алгоритм биоинформационного анализа данных высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот патогенных бактерий;
- с использованием современных методов филогенетики и филодинамики получены приоритетные данные о генетической структуре популяции и путях распространения штаммов возбудителей бруцеллёза и сибирской язвы на территории Российской Федерации;
- описаны ключевые эволюционные события, связанные с глобальным распространением Y. pestis; определено предположительное время формирования древнейшей генетической линии возбудителя чумы – 0.РЕ2, штаммы которой встречаются исключительно на территории природных очагов чумы Кавказа и Закавказья;
- предложена методика MLVA-типирования возбудителя бруцеллеза по 14 VNTR-локусам, с применением данной схемы проведено генотипирование более 100 штаммов бруцелл трех патогенных видов (B. melitensis, B. suis, B. abortus);
- сконструирован «Набор реагентов для генетического типирования штаммов возбудителей бруцеллеза B. melitensis и B. abortus методом фрагментного анализа», результатом анализа является определение принадлежности штамма к роду Brucella, виду B. melitensis/B. abortus и получение индивидуального генетического профиля исследуемой культуры (штамма), представляющий собой совокупность размеров 16 VNTR-локусов;
- стандартизована технология микрокапсулирования амфифильных и гидрофобных биологически активных веществ в микроконтейнеры на основе неионных ПАВ; разработан двустадийный метод химической модификации поверхности ниосомальных микровезикул с использованием периодатного окисления;
- разработана технология получения наночастиц хитозана на основе ионной кросс-сшивки с использованием октановой кислоты в качестве ион-парного агента;– разработана методика обеззараживания и пробоподготовки крови, подозрительной на присутствие возбудителя бруцеллеза, для анализа методом времяпролетной масс-спектрометрии, включающая процедуру получения суспензии лейкоцитов; впервые показана возможность выявления специфичных маркеров возбудителя бруцеллеза в крови больных с острой формой заболевания методом MALDI-TOF MS без этапа выделения чистой культуры или накопления возбудителя в образце.
- расшифрованы последовательности ДНК более 1000 геномов возбудителей особо опасных инфекционных болезней;
- налажено производство олигонуклеотидных праймеров для детекции и идентификации возбудителей особо опасных инфекций в рамках деятельности профильных подразделений и СПЭБ ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора;
- предложен гибкий алгоритм биоинформационного анализа данных высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот патогенных бактерий;
- с использованием современных методов филогенетики и филодинамики получены приоритетные данные о генетической структуре популяции и путях распространения штаммов возбудителей бруцеллёза и сибирской язвы на территории Российской Федерации;
- описаны ключевые эволюционные события, связанные с глобальным распространением Y. pestis; определено предположительное время формирования древнейшей генетической линии возбудителя чумы – 0.РЕ2, штаммы которой встречаются исключительно на территории природных очагов чумы Кавказа и Закавказья;
- предложена методика MLVA-типирования возбудителя бруцеллеза по 14 VNTR-локусам, с применением данной схемы проведено генотипирование более 100 штаммов бруцелл трех патогенных видов (B. melitensis, B. suis, B. abortus);
- сконструирован «Набор реагентов для генетического типирования штаммов возбудителей бруцеллеза B. melitensis и B. abortus методом фрагментного анализа», результатом анализа является определение принадлежности штамма к роду Brucella, виду B. melitensis/B. abortus и получение индивидуального генетического профиля исследуемой культуры (штамма), представляющий собой совокупность размеров 16 VNTR-локусов;
- стандартизована технология микрокапсулирования амфифильных и гидрофобных биологически активных веществ в микроконтейнеры на основе неионных ПАВ; разработан двустадийный метод химической модификации поверхности ниосомальных микровезикул с использованием периодатного окисления;
- разработана технология получения наночастиц хитозана на основе ионной кросс-сшивки с использованием октановой кислоты в качестве ион-парного агента;– разработана методика обеззараживания и пробоподготовки крови, подозрительной на присутствие возбудителя бруцеллеза, для анализа методом времяпролетной масс-спектрометрии, включающая процедуру получения суспензии лейкоцитов; впервые показана возможность выявления специфичных маркеров возбудителя бруцеллеза в крови больных с острой формой заболевания методом MALDI-TOF MS без этапа выделения чистой культуры или накопления возбудителя в образце.
_______________________________________________________________________________________________________________
