Научная работа


__________________________________________

Научные публикации
__________________________________________

NAUKA.jpg Основные направления научной деятельности

Исследования проводятся в рамках отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора на 2016-2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями» по следующим направлениям: 
• Эпидемиологический надзор за возникновением, заносом и распространением опасных инфекционных болезней.
• Диагностика, профилактика и лечение особо опасных инфекционных болезней.
• Биомедицинские аспекты изучения особо опасных и других инфекционных болезней.
• Биологическая безопасность.
__________________________________________

Перспективные  направления научно-исследовательской работы

• Разработка и внедрение прогнозно-аналитического алгоритма и моделей слежения за необычными явлениями в области общественного здравоохранения, вспышками инфекционных болезней, эпизоотической активностью природно-очаговых инфекций.
Разработка системы мониторинга природных очагов особо опасных инфекций (ООИ) на территории Юга России с помощью технологий дистанционного зондирования земли.
Разработка систем сиквенс-типирования штаммов возбудителей ООИ, включающих электронные версии баз данных и компьютерные системы анализа.
Разработка методов идентификации возбудителей ООИ с использованием MALDI-TOF масс-спектрометрии и технологии PLEX-ID.
Создание протеомных портретов штаммов возбудителей ООИ с целью совершенствования диагностики и специфической профилактики вызываемых ими инфекционных болезней.
Разработка единого алгоритма применения молекулярно-генетических методов, в т.ч. геномного и протеомного анализа, для паспортизации коллекционных штаммов возбудителей ООИ.
__________________________________________

Основные результаты научной деятельности в 2020 году

В отчетном году в институте в рамках отраслевой программы Роспотребнадзора на 2016-2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями» и в соответствии с планом Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации проведены исследования по 13 НИР, 1 НИР в рамках Распоряжения Правительства Российской Федерации от 12.10.2019 г. № 2403-р.
 
Основные результаты деятельности: 
1. Сформировано современное представление о генетическом разнообразии штаммов возбудителя сибирской язвы, циркулирующих на территории Сибири, Дальнего Востока и Республики Дагестан, на основе данных полногеномного SNP анализа. Установлена тесная филогенетическая связь изолятов B. anthracis, выделенных в Республике Дагестан, со штаммами, изолированными на территории Западной Сибири, позволяющая предположить существование в прошлом общего предка этих штаммов. 
2. На платформе ESRI-ArcGIS разработаны геоинформационные базы данных стационарно неблагополучных по сибирской язве пунктов (СНП), сибиреязвенных почвенных очагов на территориях Северо-Кавказского, Южного, Уральского федеральных округов Российской Федерации. Разработана методика многофакторного анализа и проведено ранжирование территорий Северо-Кавказского, Южного, Уральского федеральных округов Российской Федерации по степени риска осложнения эпизоотолого-эпидемиологической ситуации по сибирской язве. 
3. Впервые в структуре глобальной популяции Brucella abortus описана древнейшая генетическая ветвь, включающая штаммы из Азии. Предложена гипотеза о путях проникновения и дальнейшего распространения B. abortus на территории России. 
4. Проведен филогенетический анализ штаммов возбудителя чумы, выделенных на территории природных очагов Кавказа и Закавказья. Описаны ключевые эволюционные события, связанные с глобальным распространением Y. pestis. Определено предположительное время формирования генетической линии возбудителя чумы – 0.РЕ2, штаммы которой встречаются исключительно на территории природных очагов чумы Кавказа и Закавказья. 
5. Разработана система внутривидового типирования возбудителя чумы на основе анализа гетерогенности белковых молекул штаммов Yersinia pestis методом MALDI-TOF MS. Создана база данных референсных масс-спектров штаммов Y. pestis основного, кавказского, алтайского подвидов и Y. pseudotuberculosis, характерных для территории Кавказа, Закавказья, Сибири и Монголии, которая позволяет проводить видовую идентификацию и дифференцировать штаммы возбудителя чумы основного (наиболее вирулентного) подвида от неосновных, имеющих второстепенное эпидемиологическое значение. 
6. Проанализирована современная эпизоотолого-эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым инфекциям в г. Сочи, характеризующаяся сохранением активности природных очагов ГЛПС, лептоспироза, клещевого боррелиоза, кишечного иерсиниоза, псевдотуберкулеза, бешенства, а также их сочетанностью. 
7. Изучена циркуляция ортохантавирусов, вирусов ККГЛ и денге, риккетсий группы КПЛ, B. burgdorferii s.l. на территории рекреационных зон Черноморского побережья Краснодарского края и региона Кавказских Минеральных Вод. Получены новые данные о генетической гетерогенности ортохантавирусов, вируса ККГЛ, риккетсий группы клещевых пятнистых лихорадок, циркулировавших в районе Черноморского побережья и региона Кавказских Минеральных Вод, и особенностях их территориального распространения. 
8. Создан пополняемый Банк крови, проведен сбор репрезентативной выборки образцов крови населения Ставропольского края для серомониторинга актуальных природно-очаговых и зоонозных инфекций. Проведен анализ серопревалентности репрезентативной выборки населения г. Ставрополя в отношении возбудителей природно-очаговых и зоонозных инфекций (Ку-лихорадка, КГЛ, клещевой боррелиоз, лихорадка Западного Нила, бруцеллез). Получены новые данные об особенностях персистенции специфических антител у переболевших КГЛ в период от 1 года до 6 лет после выздоровления. 
9. Получены новые данные о молекулярно-генетическом разнообразии штаммов возбудителя холеры, выделенных на территории Кавказа с 1970 по 1998 гг. Показано, что в указанный период на Кавказе циркулировали штаммы, принадлежащие первой и второй волнам седьмой пандемии холеры. Выявлены ранее неописанные несинонимичные однонуклеотидные полиморфизмы в генах, ассоциированных с экспрессией факторов патогенности V. cholerae O1 биовара El Tor. 
10. Получены экспериментальные серии сибиреязвенных споровых магноиммуносорбентов для концентрирования спор в пробах объектов окружающей среды с целью последующей детекции B. anthracis. 
11. Разработан экспериментальный препарат для детекции противосибиреязвенных антител методом ИФА. Проведена апробация экспериментального препарата при исследовании сывороток крови больных кожной формой сибирской язвы, лиц, вакцинированных сибиреязвенной вакциной. 
12. Разработан методический подход для экстракции тотального протеома споровой и вегетативной форм сибиреязвенного микроба, обеспечивающий соблюдение режима биологической безопасности, при работе методом 2D-электрофореза и MALDI-TOF MS. 
13. Сконструирован «Набор реагентов для генетического типирования штаммов возбудителей бруцеллеза Brucella melitensis и Brucella abortus методом фрагментного анализа». Результатом анализа является определение принадлежности штамма к роду Brucella, виду B. melitensis/B. abortus и получение индивидуального генетического профиля исследуемой культуры (штамма), представляющий собой совокупность размеров 16 VNTR-локусов. 
14. Разработана технология стабилизации эритроцитарных препаратов для диагностики туляремии и индикации ее возбудителя методом лиофильного высушивания. 
15. Разработана микробиологическая питательная среда жидкая на основе экстракта кукурузной патоки для глубинного выращивания вакцинного штамма чумного микроба Y. pestis EV, обеспечивающая высокий процент живых микробных клеток в биомассе. 
16. Разработана технология получения наночастиц хитозана с ципрофлоксацином на основе ионной кросс-сшивки с использованием октановой кислоты в качестве ион-парного агента. Установлена высокая антибактериальная активность наночастиц хитозана, содержащих ципрофлоксацин, в отношении штаммов B. anthracis, B. cereus, E. coli и P. vulgaris.
__________________________________________

По результатам проведенных научно-исследовательских работ подготовлено:  

Информационно-методические письма федерального уровня: 
1. Информационно-аналитическое письмо «Об эпизоотологической и эпидемиологической ситуации по сибирской язве в 2019 году и прогнозе на 2020 г.». Письмо ФС. Вх. № 02/3190-2020-32 от 02.03.2020. 
2. Информационно-аналитическое письмо об эпидемиологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах Российской Федерации в 2019 г. Письмо ФС. Вх. № 02/798-2020-32 от 23.01.2020. 
3. Информационно-аналитический обзор эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по бруцеллёзу в Российской Федерации в 2019 году и прогноз на 2020 год. Письмо ФС. Вх. № 02/5600-2020-32 от 31.03.2020.  Опубликован аналитический обзор «Эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым инфекционным болезням в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в 2019 г.». 
 
Опубликован информационный бюллетень «Бруцеллез в Российской Федерации в 2019 г.». Письмо ФС. Вх. № 02/14274-2020-32 от 17.07.2020. 
 
Разработаны проекты разделов в санитарные правила и нормы (СанПин, СП) «Профилактика и управление рисками инфекционных и паразитарных болезней»: 1.  Раздел «Профилактика сибирской язвы». Направлены в ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора. Исх. от 12.08.2020  № 26-30-12/11-1245-2020. 
2. Раздел «Профилактика бруцеллёза». Направлены в ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора. Исх. от 25.08.2020 № 26-30-12/11-1333-2020. 
 
Разработаны методические рекомендации (МР) федерального уровня: 
1. МР 3.1.0207-20 «Цитометрический анализ антигенреактивности лейкоцитов in vitro для диагностики и оценки эффективности иммунопрофилактики бруцеллёза у людей». Утверждены руководителем Роспотребнадзора А.Ю. Поповой 19.08.2020. 
2. Проект МР «Методика применения беспилотных летательных аппаратов при эпизоотологическом обследовании природных очагов чумы». Направлены в ФКУЗ «Противочумный центр» Роспотребнадзора. Исх. от 11.12.2020 № 26-30-14/11-1936-2020. 

Опубликовано: Опубликовано 93 научные работы, из них в ведущих рецензируемых научных журналах и изданиях, рекомендованных ВАК ­– 24, в зарубежных изданиях - 2. Депонировано в международную базу данных GenBank 48 полногеномных нуклеотидных последовательностей: Yersinia pestis - 2, Brucella abortus - 19, Vibrio сholerae – 9, Orthohantavirus – 21.    

Получено: Получено 9 патентов РФ на изобретения, зарегистрировано 10 электронных баз данных. Подано 12 заявок в ФИПС на предполагаемые  изобретения. 
 
В отчетный период 16 специалистов института приняли участие с устными докладами в 10 научно-практических конференциях, совещаниях и семинарах (регионального, федерального, российского и международного уровня), в том числе по линии ВОЗ. Подготовлена и защищена 1 диссертация на соискание ученой степени кандидата наук (Ульшина Д.В.). 
В 2020 году по программам дополнительного профессионального образования (профессиональная переподготовка) подготовлено 19 специалистов, по программам дополнительного профессионального образования (повышение квалификации) – 20 человек. 
Осуществлена подготовка специалистов других учреждений на рабочих местах (лабораторная диагностика COVID-19): на базе ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора – 28 человек, при выездах СПЭБ – 23 человека.   
__________________________________________
 
В рамках научно-организационной работы института проведено совещание руководителей противочумных станций, курируемых ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, по вопросам организации и проведения мониторинга за чумой и другими природно-очаговыми инфекциями и взаимодействия противочумных станций с институтом, органами и организациями Роспотребнадзора, 11 заседаний Ученого совета, 4 заседания проблемно-методической комиссии с рассмотрением вопросов планирования новых НИР и анализом результатов завершенных НИР и 24 заседания экспертной комиссии с экспертной оценкой материалов, предназначенных для опубликования в открытой печати.
__________________________________________