Научная работа


__________________________________________

•  Научные публикации
__________________________________________

NAUKA.jpg Основные направления научной деятельности

Исследования проводятся в рамках отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора на 2016-2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями» по следующим направлениям: 
• Эпидемиологический надзор за возникновением, заносом и распространением опасных инфекционных болезней.
• Диагностика, профилактика и лечение особо опасных инфекционных болезней.
• Биомедицинские аспекты изучения особо опасных и других инфекционных болезней.
• Биологическая безопасность.
__________________________________________

Перспективные  направления научно-исследовательской работы

• Разработка и внедрение прогнозно-аналитического алгоритма и моделей слежения за необычными явлениями в области общественного здравоохранения, вспышками инфекционных болезней, эпизоотической активностью природно-очаговых инфекций.
Разработка системы мониторинга природных очагов особо опасных инфекций (ООИ) на территории Юга России с помощью технологий дистанционного зондирования земли.
Разработка систем сиквенс-типирования штаммов возбудителей ООИ, включающих электронные версии баз данных и компьютерные системы анализа.
Разработка методов идентификации возбудителей ООИ с использованием MALDI-TOF масс-спектрометрии и технологии PLEX-ID.
Создание протеомных портретов штаммов возбудителей ООИ с целью совершенствования диагностики и специфической профилактики вызываемых ими инфекционных болезней.
Разработка единого алгоритма применения молекулярно-генетических методов, в т.ч. геномного и протеомного анализа, для паспортизации коллекционных штаммов возбудителей ООИ.
Разработка технологии конструирования ниосомальных нановезикул для рецептор-направленного транспорта биологически активных веществ в ткани-мишени, создания ДНК-вакцин. 
__________________________________________

Основные результаты научной деятельности в 2016 году

В отчетном году в институте проведены исследования по 16 НИР,
выполняемых в рамках отраслевой программы Роспотребнадзора на 2016-2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями».  

Выполнен молекулярно-генетический мониторинг популяции вируса ККГЛ на юге России. Осуществлено генетическое типирование вируса ККГЛ, выявленного в клиническом материале от больных КГЛ и в суспензиях клещей. Разработана методика генетического типирования методом прямого секвенирования трех участков генома вируса с последующим филогенетическим анализом. Установлено, что представители разных генетических подгрупп вируса ККГЛ формируют отдельные локальные и частично перекрывающиеся очаги.   

Внедрены новые методы экспресс-аллергодиагностики бруцеллеза и сибирской язвы на основе теста антигенной стимуляции клеток. Разработан риск-ориентированный подход для прогнозирования формирования иммуносупрессивного состояния у больных бруцеллезом. 

Впервые разработан метод SNP-генотипирования Bacillus anthracis на основе минисеквенирования ДНК с детекцией ВП-МАЛДИ МС. Получены новые данные о SNP-генотипах штаммов B. anthracis разного географического происхождения. Создана база данных canSNP-генотипов штаммов B. anthracis.  

Представлены результаты оценки глобального филогеографического разнообразия штаммов Brucella melitensis на основе полногеномного SNP анализа. Впервые определены единичные нуклеотидные замены, позволяющих дифференцировать разные генотипы возбудителя бруцеллеза. Получены  референсные масс-спектры штаммов возбудителей бруцеллеза и чумы с использованием MALDI-TOF масс-спектрометрии. Предложен способ подготовки крови, подозрительной на содержание возбудителя бруцеллеза, для исследования методом масс-спектрометрии.  

Разработан с использованием ГИС-технологий электронный атлас-кадастр сибиреязвенных скотомогильников, включающий сведения по эпидемиологической и эпизоотологической ситуации, экологическому и хозяйственно-экономическому фону административных районов.  

Разработана НД на тест-систему магноиммуносорбентную иммуноферментную для выявления типичных и дефектных по синтезу фракции I штаммов чумного микроба, проведены лабораторные и межлабораторные испытания.  

Подготовлен и утвержден новый Промышленный регламент на производство вакцины чумной живой, лиофилизата для приготовления суспензии для инъекций, накожного скарификационного нанесения и ингаляций (ПР 01897080-09-16, взамен ПР 01897080-09-09).
__________________________________________


По результатам проведенных научно-исследовательских работ подготовлены:  

3 информационно-методических письма федерального уровня:
• «Анализ эпидемиологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в Российской Федерации в 2015 году и прогноз на 2016 год»;
• «Об эпизоотолого-эпидемиологической  ситуации по сибирской язве в мире в 2015 году и прогнозе на 2016 год»;
• «Обзор эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по бруцеллезу в 2015 году и прогноз на 2016 год»;

Информационный бюллетень «Бруцеллез в Российской Федерации в 2015 г.». Проект бюллетеня направлен в Роспотребнадзор;

Методические рекомендации 3.5.2.0110-16 «Организация и проведение мероприятий по энтомологическому мониторингу и регуляции численности кровососущих комаров Aedes aegypti и Aedes albopictus». 

Рассмотрены, одобрены Ученым советом и утверждены директором института 11  методических рекомендаций, учрежденческого уровня; 5 баз данных; 3 пакета НД на МИБП; изменения в ФСП, инструкцию по применению, регистрационное удостоверение на препарат «Вакцина чумная живая, лиофилизат для приготовления суспензии для инъекций, накожного скарификационного нанесения и ингаляций».

В рамках совместных НИР подготовлены:
- 2 раздела в  проект Методических указаний «Организация и проведение первичных противоэпидемических мероприятий в случаях выявления больного (трупа), подозрительного на заболевания инфекционными болезнями, вызывающими чрезвычайные ситуации в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения»;
- 6 разделов в проект Методических указаний «Паспортизация природных очагов чумы Российской Федерации»;
- 12 разделов  в   проект Методических указаний «Отлов, учет и прогноз численности мелких млекопитающих и птиц в природных очагах инфекционных болезней»;
- 3 раздела в проект Методических указаний по прогнозированию эпизоотической активности природных очагов чумы Российской Федерации;
- 3 раздела в проект Методических указаний «Организация и проведение лабораторной диагностики инфекционных болезней и лабораторного контроля объектов окружающей среды, пищевых продуктов и производственного сырья во время массовых мероприятий»;
- раздел по критериям отбора сибиреязвенных вакцинных штаммов в проект Методических указаний «Основные требования к вакцинным штаммам сибиреязвенного микроба, применяемым для иммунизации людей».

Опубликовано 146 научных работ, из них в ведущих рецензируемых научных журналах и изданиях, рекомендованных ВАК - 44, в зарубежных изданиях – 14.
__________________________________________

Изданы:
1.  Монография «Сибирская язва на Северном Кавказе». – Майкоп: Качество, 2016. – 198 с. – ISBN 978-5-9703-0540-9;
2. Практическое руководство «Лихорадка Зика: эпидемиология, клиника, лабораторная диагностика и меры профилактики» / под ред. А.Ю. Поповой, А.В. Топоркова – Волгоград: Волга-Пресс, 2016. - 192 с. – ISBN 978-5-9908533-0-0; 
3. Монография «Анаплазмоз овец» / С.Н. Луцук, Ю.В. Дьяченко, Ю.М. Тохов, В.П. Толоконников, А.Н. Логвинов. – Ставрополь: Агрус, 2016. – 128 с. - ISBN 978-5-9596-1252-8;
4. Учебное пособие  «Учебная практика по зоологии» / М.П. Ильюх, Б.К. Котти, С.В. Пушкин, А.Н. Хохлов. –  Ставрополь: Изд-во СКФУ,  2016. – 108 с.;
5. Монография «Малый суслик (Spermophilus pygmaeus Pallas, 1778, Rodentia) в Прикаспии и Предкавказье» / Н.В, Попов, А.К. Гражданов, С.А. Яковлев, А.Н. Матросов, М.П. Григорьев, О.А. Белова, Н.В. Ермолова, А.Н. Куличенко и др. – Саратов: Амирит, 2016. - 216 с.: табл. - Библиогр.: с. 215-235. - 500. - ISBN 978-5-9907116-6-2;
6. Аналитический обзор «Эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым инфекционным болезням в Южном, Северо-Кавказском и Крымском федеральных округах в 2015 г.» - Ставрополь: [Литера], 2016. - 95 с.: ил. - 100. – ISBN 978-5-91662-010-8.
__________________________________________

Депонирование в международную базу данных GenBank:
последовательности ДНК 5 штаммов Brucella melitensis: И-349, КИВ-Л, И-136, И-216, И-338.

Получено 5 патентов РФ на изобретения и полезную модель.
Зарегистрированы 2 базы  данных:
- база данных MLVA-генотипов штаммов возбудителя бруцеллеза. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 20166200351 от 16 марта 2016 г.;
- база данных «Белковые профили масс-спектров микроорганизмов I-II групп патогенности для программы MALDI Biotyper». Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2016620345 от 15 марта 2016 г.
__________________________________________

Подготовлено и защищено соискателями  института 2 работы на соискание ученой степени кандидата наук.  

48 специалистов института приняли участие с устными докладами в 27 научно-практических конференциях, совещаниях и семинарах (регионального, федерального, российского и международного уровня), в том числе по линии ВОЗ.

В рамках научно-организационной работы института проведено совещание руководителей противочумных станций, курируемых ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, по вопросам организации и проведения мониторинга за чумой и другими природно-очаговыми инфекциями и взаимодействия противочумных станций с институтом, органами и организациями Роспотребнадзора, 11 заседаний Ученого совета, 6 заседаний проблемно-методической комиссии и 22 заседания экспертной комиссии с рассмотрением вопросов планирования новых НИР и анализом результатов завершенных НИР, экспертной оценкой материалов, предназначенных для опубликования в открытой печати.
__________________________________________